SQLite

データの管理はデータベースが望ましいが、ODBCはなんかうまくいかない。

SQLite3 + RSQLite の組み合わせがよかったので報告する。

• Excelからの書き出し
  • CSV (区切り文字= "," ダブルクオートする）で書き出す
• テキストエディタで開く
  • 1行目に、データベースの変数名を,で区切って書き出す
  • UTF-8, 行末 LFで変換して書き出す
• FireFoxにSQLite Managerアドオンを追加
  • Firefoxのツール＞SQLite Managerを起動
  • ツールバーから、データベースを作成ボタンを押す
  • ツールバーの、取り込みボタンを押す→Import Wizardから読み込み

参照と検索で、確認しましょう

これで test3.sqliteにデータベースを作ることができた。
これをRに読ませるには

library(RSQLite)
s<-dbDriver("SQLite")
con<-dbConnect(s,dbname="/full/path/to/test3.sqlite")
d<-dbReadTable(con,"test")
dbDisconnect(con)
summary(d)

     name             disease               ACS            Lhratio      
 Length:66          Length:66          Min.   :0.0000   Min.   :0.3434  
 Class :character   Class :character   1st Qu.:0.0000   1st Qu.:1.6915  
 Mode  :character   Mode  :character   Median :0.0000   Median :2.1898  
                                       Mean   :0.3939   Mean   :2.2973  
                                       3rd Qu.:1.0000   3rd Qu.:2.8353  
                                       Max.   :1.0000   Max.   :5.2500  

library(gplots)
plotmeans(Lhratio~ACS,data=d,connect=FALSE)